上海中医药大学协爱泽安中医医院是经上海市卫健委批准的专业医疗机构，位于嘉定区城中路2号；是一家集医疗、康复、护理为一体的中西医结合为特色的大型现代化中医综合医院。

上海中医药大学协爱康安中医医院是经上海市卫健委批准的医保定点单位、异地医保结算单位、大病医保结算单位；医院位于上海市崇明区长兴岛潘园公路旁，建筑面积1.3万平方米，可开放床位400张。

上海中医药大学温州协爱医院是温州市医保定点单位，温州市特殊病种定点医疗机构。依照三级医院标准规划建设，建筑面积2.4万平方米、开放床位600余张，重点建设五大学科：康复医学、亚重症医学、老年医学、认知障碍、脑病，是一家集临床、康复、养老、护理四位一体的现代化医院。

上海中医药大学宁波海曙协爱中医医院是宁波市医保定点单位，依照三级医院标准建设，面积近3万平方米，开放床位600余张；医院中西医结合特色显著，优势突出，重点建设五大学科：康复医学、老年医学、认知障碍、心身医学科；是一家集预防、保健、医疗、康复于一体的现代化医院。

上海中医药大学福州协爱医院是与上海中医药大学共建的一家二级综合性医院，为省、市医保定点单位。医院坐落于马尾区，占地面积10亩，总建筑面积30000平方米。

上海中医药大学协爱德胜堂医院是上海市医保定点单位。医院中西医结合特色显著，优势突出，重点建设五大学科：康复医学、亚重症医学、老年医学、认知障碍、肿瘤；是一家集医疗、教学于一体的现代化医院。

上海中医药大学协爱栋安中医医院位于宝山区宝安公路7弄9、10号；是上海市卫健委批准的二级医疗机构。一期建筑面积2万多平方米，开放床位六百张。

上海中医药大学协爱中医医院坐落于上海奉贤东部区域，地处临港国际自由贸易开发区，是奉贤东乡区域唯一一所由上海市卫健委批准设置的二级中医类别医院：占地面积3万平方米，总建筑面积17500万平方米。